Inhoudsopgave

1. Inleiding: PubMed, Medline en PreMedline
2. Zoeken in PubMed
2.1. Hulp bij het zoeken in PubMed
2.2. Zoeken op onderwerp
2.2.1. Medline-trefwoorden: MeSH Terms en subheadings
2.2.2. Automatic Term Mapping
2.2.3. Details: hoe heeft PubMed gezocht?
2.2.4. Zoeken via de MeSH Browser
2.3. Zoeken in afzonderlijke velden
2.3.1. Zoeken op auteur
2.3.2. De Journal Browser: zoeken op tijdschriftnaam
2.3.3. Zoeken op talen
2.4.De Single Citation Matcher: opzoeken van een bekende referentie
2.5. De zoekgeschiedenis
2.6. Combineren
2.7. Trunceren
2.8. Zoeken via de indexen: Preview/Index
2.9. Limits: zoeken met inperkingen
2.9.1. velden
2.9.2. publicatietypen
2.9.3. leeftijden
2.9.4. invoerdatum (Entrez Date)
2.9.5. publicatiedatum
2.9.6. referenties met een samenvatting
2.9.7. talen
2.9.8. mens/dier
2.9.9. subset
2.9.10. geslacht
3. Referenties
3.1. Preview
3.2. Format van de referenties
3.3. Aantal referenties per pagina
3.4. Related articles
3.5. Links naar full text artikelen
3.6. Selecteren van referenties; clipboard
3.7. Sorteren van referenties
3.8. Downloaden van referenties
3.9. Afdrukken van referenties
4. Opslaan en later opnieuw uitvoeren van een zoekstrategie
5. Attenderingen via Cubby

Bijlagen:
1. Alfabetische lijst van subheadings
2. Subheadings op onderwerp gerangschikt
3. PubMed-zoekvelden en hun afkortingend en PreMedline

    1.Inleiding: PubMed, Medline en PreMedline

Pubmed is via internet vrij toegankelijk via
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/
PubMed is een bestand met beschrijvingen (referenties) van tijdschriftartikelen. Het omvat Medline, PreMedline en nog een aantal kleinere bestanden.

Medline is een bestand met referenties van artikelen uit meer dan 4300 tijdschriften op het gebied van geneeskunde en verwante vakgebieden, gepubliceerd in meer dan 70 landen. Het merendeel van de beschreven artikelen komt uit Engelstalige tijdschriften.

Het bestand gaat terug tot 1966 en bevat meer dan 10 miljoen referenties. Er bestaan verschillende versies van Medline - met verschillende zoeksoftware - alle gebaseerd op dezelfde database.

De Medline-referenties bestaan uit verschillende onderdelen (velden), met o.a. de auteur(s) en de titel van het artikel, tijdschriftgegevens, toegevoegde trefwoorden (MeSH Terms, zie 2.2.1.) en een samenvatting.

Medline-referentie uit PubMed

PreMedline bevat referenties die nog niet van MeSH Terms zijn voorzien. Ze bevatten in PubMed de aanduiding "Medline record in process". Na het toevoegen van MeSH Terms verhuizen deze referenties naar Medline.

PubMed wordt dagelijks met nieuwe PreMedline-referenties aangevuld; wekelijks verhuist een deel van de PreMedline-referenties naar Medline.

    2. Zoeken in PubMed

In PubMed kan op veel verschillende manieren worden gezocht, van eenvoudig tot zeer geavanceerd.

In alle PubMed-schermen is een zoekbalk aanwezig waarop een of meer zoektermen kunnen worden ingetypt. Het systeem van Automatic Term Mapping probeert vervolgens die zoektermen om te zetten in geschikte PubMed-termen (waaronder MeSH Terms).

Volgens de toelichting in het begin-scherm van PubMed, kunnen o.a. auteurs- of tijdschriftnamen als zoekwoord worden ingetypt. Gebruik hiervoor echter bij voorkeur de specifiekere zoekmethoden zoals beschreven in 2.3.1 en 2.3.3.

Begin-scherm van PubMed

    2.1. Hulp bij het zoeken in PubMed

PubMed biedt goede ondersteuning tijdens het zoeken, o.a. via de opties Help, Overview en FAQ (Frequently Asked Questions; in de zijbalk).

Een speciale PubMed-cursus kan gedownload worden vanaf http://www.nlm.nih.gov/pubs/web_based.html

Ook kan hulp gevraagd worden aan medewerkers van de Walaeus Bibliotheek.

    2.2. Zoeken op onderwerp

Op de zoekbalk worden een of meer woorden getypt, bijvoorbeeld:

 

heart	enkelvoudige zoekterm
heart attack	frase (zoekterm die uit 2 of meer woorden bestaat
heart attack sports	combinatie van zoektermen

Daarna wordt op <Enter> gedrukt of op Go geklikt. Vervolgens verschijnt het referentie-scherm.

Referentie-scherm van PubMed

    2.2.1. Medline-trefwoorden: MeSH Terms en subheadings

MeSH Terms (Medical Subject Headings) zijn vaste trefwoorden die door indexeerders aan de Medline-referenties zijn toegevoegd. Er zijn thans ca. 19.000 MeSH Terms, die tezamen een hiërarchisch systeem vormen.

PubMed bevat een uitgebreid systeem van Automatic Term Mapping om bij zoektermen de passende MeSH Terms te vinden (zie 2.2.2.), en biedt via de MeSH Browser (zie 2.2.4.) de mogelijkheid te grasduinen in het hiërarchische systeem van de MeSH Terms.

De indexeerders kennen gemiddeld 12 MeSH Terms per referentie toe. Gemiddeld 3 daarvan worden als belangrijk gekenmerkt (Major Topic); deze zijn in de referenties te herkennen aan een *. Het is mogelijk specifiek op Major MeSH Terms te zoeken (zie 2.2.4.).

Aan MeSH Terms zijn in veel gevallen subheadings toegevoegd, waarmee een nadere specificatie wordt aangegeven, bijvoorbeeld adverse effects of therapeutic use als toevoeging bij een MeSH Term betreffende een geneesmiddel. Via de MeSH Browser (zie 2.2.4.) kan op combinaties van MeSH Terms en subheadings worden gezocht.

Voor een overzicht van de 82 verschillende subheadings, zie bijlagen 1 en 2.

    2.2.2. Automatic Term Mapping

Bij het zoeken op onderwerp is het belangrijk dat enerzijds MeSH Terms en anderzijds free text termen worden gebruikt. Met de MeSH Terms wordt Medline grondig doorzocht. Free text is de enige zoekmogelijkheid voor PreMedline, en kan ook (aanvullend) resultaat opleveren in Medline; bij deze wijze van zoeken is het belangrijk synoniemen en woordvarianten te bedenken.

PubMed gebruikt het systeem van Automatic Term Mapping om woorden op de zoekbalk zo mogelijk om te zetten in MeSH Terms en free text termen. Dit werkt als volgt:

• de computer gaat na of de zoektermen overeenkomen met (verwijzingen naar) MeSH Terms
  
• als dat het geval is wordt op die MeSH Terms gezocht, en bovendien nog op de zoektermen als Text Word (free text woord in o.a. titel, samenvatting)
  
• als geen MeSH Terms worden gevonden, worden de ingetypte zoektermen in All Fields (free text in alle velden) gezocht.

    2.2.3. Details: hoe heeft PubMed gezocht?

Via de optie Details in het referentie-scherm wordt het Details-scherm opgeroepen, dat laat zien hoe PubMed gezocht heeft.

Desgewenst kunnen veranderingen in de zoekactie worden aangebracht, bijvoorbeeld door het toevoegen van zoektermen. Via Search wordt de gewijzigde zoekactie daarna uitgevoerd.

 

N.B.	Als een zoekwoord getrunceerd is, wordt de Automatic Term Mapping uitgezet. Zie ook 2.7.

Enige voorbeelden van zoekwoorden en zoekacties:

 

Zoekwoord(en)	Zoekactie uitgevoerd in PubMed
heart	heart[MeSH Terms] OR heart[Text Word])
heart attack	myocardial infarction[MeSH Terms] OR heart attack[Text Word]
attack heart	attack[All Fields] AND (heart[MeSH Terms] OR heart[Text Word])
heart attack*	heart attack[All Fields] OR heart attacks[All Fields])

    2.2.4. Zoeken via de MeSH Browser

De MeSH Browser (zijbalk) helpt bij het opsporen van MeSH Terms en toont deze in hun hiërarchische omgeving. Tevens wordt vaak informatie over een term getoond, bijvoorbeeld in de vorm van een omschrijving.

Via Detailed Display kunnen MeSH terms tot Major Topic worden ingeperkt en kunnen subheadings worden toegevoegd (zie 2.2.1.).

Via Add en PubMed Search worden MeSH terms aan de PubMed-zoekactie toegevoegd.

 

Het is belangrijk de MeSH Browser te gebruiken als via Details blijkt dat geen MeSH Terms in de zoekactie betrokken werden. Als het systeem van Automatic Term Mapping geen MeSH Terms opspoorde betekent dat niet dat ze er niet zijn! Een zoekactie via de MeSH Browser dient nog aangevuld te worden met free text zoekwoorden, om zo ook de PreMedline-referenties (die nog geen MeSH Terms hebben) in het zoekresultaat te betrekken.

   2.3. Zoeken in afzonderlijke velden

Op verschillende manieren kan in afzonderlijke velden worden gezocht

• Met veldaanduidingen (zie bijlage 3 voor een overzicht)
  
• Via Preview/Index (zie 2.8.)
  
• Via Limit (zie 2.9.)

Voorbeelden van het zoeken met veldaanduidingen:

 

Zoekterm	Zoeken in het veld
melanoma[ti]	titel
dutch[la]	taal
davis[au]	auteur

    2.3.1. Zoeken op auteur

Via de zoekbalk kan direct gezocht worden op auteur, bij voorkeur met de veldaanduiding [au].

Zonder veldaanduiding wordt meestal in All Fields gezocht; bij sommige auteursnamen (bijvoorbeeld Rabbit) wordt via het Automatic Term Mapping systeem op MeSH Terms en Text Word gezocht, hetgeen uiteraard niet de bedoeling was.

Enige voorbeelden:

 

Zoekterm	Er wordt gezocht op
rabbit	Rabbits[MeSH Terms] OR Rabbit[Text Word]
rabbit[au]	Achternaam Rabbit met verschillende initialen
davis[au]	Achternaam Davis met verschillende initialen
davis A[au]	Achternaam Davis A, DavisAA, Davis AB, etc.
davis AB[au]	Achternaam Davis AB
"davis A"[au] of davis a@[au]	Achternaam Davis A

Ook via Limits (zie 2.9.) kan specifiek in het auteursveld gezocht worden.

Via Preview/Index (zie 2.8.) kan de auteurs-index worden opgeroepen (geheel onderaan het Preview-scherm). De betekenis van de auteursnamen in de index is als volgt:

 

Vermelding in index	Er wordt gezocht op
davis	alle auteurs Davis
davis A	Davis A, Davis AB, Davis AE, etc
davis AB	Davis AB
davis A@	Davis A

    2.3.2. De Journal Browser: zoeken op tijdschriftnaam

Op de zoekbalk kan een volledige of afgekorte tijdschriftnaam of een ISSN (International Standard Serial Number) worden getypt.

Bij voorkeur wordt echter via de Journal Browser (zijbalk) naar tijdschriften gezocht, op afzonderlijke woorden uit de titel, eventueel met een truncatie.

Voorbeelden:

 

Zoeken in Journal Browser	Zoekresultaat
ned	9 tijdschriften, waaronder Ned Tijdschr Geneeskd
nederlands	6 tijdschriften, waaronder Ned Tijdschr Geneeskd
ned tijdschr geneesk	Ned Tijdschr Geneeskd
0028-2162	Ned Tijdschr Geneeskd
00282162	géén resultaat

In de lijst van gevonden tijdschriften kan het ISSN of de afgekorte naam van een tijdschrift worden aangeklikt.

Via de afgekorte naam wordt in PubMed op het tijdschrift gezocht. Als zoekterm blijkt dan het ISSN gebruikt te zijn.

Klikken op het ISSN van een tijdschrift leidt naar een soort systeemkaart met informatie over het tijdschrift, met o.a. vaak de URL van het full text tijdschrift.

    2.3.3. Zoeken op talen

Op de zoekbalk kan de volledige naam van de taal met de veldaanduiding [la] getypt worden. Voorbeelden:

Voor inperken op talen zie 2.9.7.

2.4. De Single Citation Matcher: opzoeken van een bekende referentie

Via de Single Citation Matcher (zijbalk) kunnen met een minimum aan ingevulde informatie (bijvoorbeeld alleen tijdschriftnaam en paginanummer) referenties van reeds bekende publicaties worden opgezocht.

Voor het invullen van de tijdschriftnaam kan de Journal Browser gebruikt worden. De daar opgespoorde naam wordt via kopiëren en plakken naar de Single Citation Matcher overgebracht.

De Single Citation Matcher

Toepassingen van deze wijze van zoeken zijn o.a.:

• Het opsporen van de samenvatting van een artikel dat niet in de bibliotheek beschikbaar is
• Het aanvullen of corrigeren van een onvolledige of foute artikelbeschrijvingen
  
• Het opslaan van de referentie in een database, zoals Reference Manager

2.5. De zoekgeschiedenis

Via History wordt het scherm met de zoekgeschiedenis opgeroepen: een opsomming van alle tot dan toe gevormde sets (afzonderlijke zoekacties).

Dit scherm kan gebruikt worden voor het combineren van sets (zie 2.6.) en voor het opnieuw oproepen van oude zoekacties.

Vanuit het History-scherm wordt het referentie-scherm bereikt door op het referentie-aantal van de gewenste set of op Go te klikken.

Via Clear History wordt de hele zoekgeschiedenis verwijderd. Het is niet mogelijk afzonderlijke sets te verwijderen.

History-scherm van PubMed

2.6. Combineren

Tussen sets en/of zoektermen (woorden, frases, auteursnamen, tijdschriftnamen, etc.) kunnen verschillende soorten combinaties gemaakt worden: AND, OR en NOT.

Combineren kan op verschillende manieren, waarbij op de zoekbalk worden getypt:

• Twee of meer woorden. Het systeem van Automatic Term Mapping vertaalt ze zo mogelijk naar een of meer MeSH Terms, en zoekt tevens in Text Words of All Fields. Tussen verschillende variaties voor één begrip (bijvoorbeeld MeSH Term en Text word) wordt een OR-combinatie aangebracht, tussen de verschillende begrippen een AND-combinatie.
• Combinaties van zoektermen.
• Combinaties van sets of combinaties tussen sets en zoektermen. Voor de setnummers moet een # getypt worden; AND, OR en NOT moeten met hoofdletters getypt worden.

Enige voorbeelden:

 

Zoekwoorden	Zoekactie
heart attack sports	(myocardial infarction"[MeSH Terms] OR heart attack[Text Word]) AND ("sports"[MeSH Terms] OR sports[Text Word]))
heart attack AND sports
#2 AND (#3 OR #5)	afhankelijk van de inhoud van de gebruikte sets
#2 AND liver[ti]
#3 AND (football OR tennis)

 

AND, OR en NOT moeten met hoofdletters getypt worden. De AND, OR- en NOT-combinaties worden uitgevoerd in de volgorde waarin ze in een zoekactie gebruikt worden. Met haakjes kan men een andere volgorde bewerkstelligen.

2.7. Trunceren

Via truncatie wordt gezocht op de OR-combinatie van zoektermen die met dezelfde woordstam beginnen. Die woordstam wordt afgesloten met het truncatieteken, de *

Met bacter* wordt gezocht op alle woorden die met bacter beginnen.

 

Voor het free text zoeken (met name belangrijk voor PreMedline) is trunceren heel nuttig. Echter, op getrunceerde zoekwoorden wordt het systeem van Automatic Term Mapping niet toegepast, waardoor geen vertaling naar MeSH Terms plaatsvindt. Om te profiteren van zowel Automatic Term Mapping als truncatie kan de OR-combinatie van een wel en een niet getrunceerd zoekwoord getypt worden. Voorbeeld: coumarins OR coumarin*, Let wel op of er werkelijk een MeSH Term in de zoekactie wordt opgenomen!

2.8. Zoeken via indexen: Preview/Index

Via Preview/Index wordt het Preview/Index-scherm bereikt, waarin de zoekgeschiedenis van de 3 laatstgevormde sets is aangegeven, en waarin (geheel onderaan!) indexen van verschillende velden kunnen worden opgeroepen.

Na het kiezen van een veld en het typen van een woord(deel) op de ernaast gelegen balk wordt op Index geklikt, waarna een deel van de index verschijnt. Via Up of Down worden andere termen bereikt.

Een of meer termen (voor meer termen: gebruik de Ctrl-knop) in de index kunnen worden aangeklikt , waarna op AND, OR of NOT wordt geklikt.

Als de zoekbalk leeg was verschijnen daarin alleen de gekozen termen; stond er nog een term op de zoekbalk, dan wordt de gekozen term daaraan toegevoegd.

Preview/Index-scherm van PubMed

2.9. Limits: Zoeken met inperkingen

Via Limits kunnen inperkingen worden ingesteld op de volgende categorieën:

• afzonderlijke velden
• aanwezigheid van een samenvatting
• publicatietypen
• taal
• leeftijdsgroepen
• mens/dier
• invoerdatum (Entrez date)
• subset
• publicatie-datum
• geslacht

Een of meer van deze inperkingscategorieën kunnen ingesteld worden. Binnen een categorie kan slechts één keuze gemaakt worden.

Na zoeken met inperkingen staan op het referentie-scherm, in een gele balk, de ingestelde inperkingen aangegeven.

Met een V voor de Limits-optie wordt aangegeven dat een of meer inperkingen ingesteld staan. Ze zijn alle in een keer te verwijderen door de V weg te klikken.

Inperkingen, aangegeven in het referentie-scherm

N.B. Inperken op publicatietypen, leeftijden, geslacht en mens/dier betekent tevens een inperking tot alleen Medline-referenties. PreMedline-referenties, de meest recente PubMed-referenties worden automatisch uitgesloten, aangezien zij nog niet volledig geïndexeerd zijn, en de genoemde inperkingscategorieën niet bezitten.

2.9.1. Inperken op velden

Inperken op een afzonderlijk veld betekent in feite: zoeken in dat veld.

Velden die voor Limits in aanmerking komen zijn o.a. Author Name, Language, Title Word. In deze velden kan ook direct gezocht, worden zonder toepassing van Limit, door de bijbehorende veldaanduiding achter het zoekwoord te typen (zie 2.3.).

Voor andere Limit-velden zijn handiger zoekmogelijkheden ter beschikking, bijvoorbeeld:

 

Inperkings-veld	Bij voorkeur werken met
Entrez date	Limit-optie onder Entrez Date
Issue, Page Number, Volume	Single Citation Matcher (zie 2.9.4.)
Journal Name	Journal Browser (zie 2.4.)
MeSH Terms, MeSH Major Topic	MeSH Browser (zie 2.2.4.)

2.9.2. Inperken op publicatietypen

Uit de volgende publicatietypen kan gekozen worden:

• Clinical Trial
• Practice Guideline
• Editorial
• Randomized Controlled Trial
• Letter
• Review
• Meta-Analysis

Meer typen zijn beschikbaar; zie de Help-functie in PubMed.

2.9.3. Inperken op leeftijden

De volgende leeftijdsgroepen zijn beschikbaar:

• All Infant: birth-23 month
• All Child: 0-18 years
• All Adult:19+ years
• Newborn: birth-1month
• Infant: 1-23 months
• Preschool Child: 2-5 years
• Child: 6-12 years
• Adolescent: 13-18 years
• Adult:19-44 years
• Middle Aged:45-64 years
• Aged:65+ years
• 80 and over: 80+ years

De eerste 3 opties zijn samenstellingen van een aantal van de andere opties.

2.9.4. Inperken op invoerdatum (Entrez Date)

Er is een aantal periode-categorieën beschikbaar, variërend van 30 dagen tot 10 jaar.

De Entrez Date heeft betrekking op de invoerdatum in PubMed.

2.9.5. Inperken op publicatiedatum

Publication Date en Entrez Date zijn als alternatieven beschikbaar.

Een begin- en einddatum kunnen worden ingevuld: 4 posities voor het jaar, 2 voor de maand en 2 voor de dag. Maanden en dagen hoeven niet ingevuld te worden.

2.9.6. Inperken op referenties met een samenvatting

Voor 1975 werden geen samenvattingen toegevoegd. Vanaf dat jaar zijn ze in toenemende mate beschikbaar. Thans zijn samenvattingen beschikbaar als het beschreven artikel een Engelstalige samenvatting bezit.

2.9.7. Inperken op taal

De aangeboden talen zijn Engels, Frans, Duits, Italiaans, Japans, Russisch en Spaans; er kan slechts op 1 taal tegelijk worden ingeperkt.

In PubMed zijn veel meer talen beschikbaar, waaronder bijvoorbeeld Nederlands.

Voor inperken op een niet aangeboden taal, of op een aantal talen kan via de zoekbalk gewerkt worden, waarbij de namen van de talen voluit gespeld worden, en de taalaanduiding [la] gebruikt wordt.

Voorbeelden:

 

melanoma AND dutch[la]

#4 AND (dutch[la] OR english[la] OR german [la])

2.9.8. Inperken op mens/dier

De opties Human en Animal zijn beschikbaar.

2.9.9. Inperken op subset

De volgende opties zijn beschikbaar:

 

Subset	Omschrijving
AIDS	Referenties betreffende AIDS
AIM	Abridged Index Medicus, een subset van Medline, met 120 (voornamelijk Amerikaanse) top-tijdschriften
Complementary Medicine	Referenties betreffende "complementary" en alternatieve geneeskunde
Dental	Referenties op het gebied van de Tandheelkunde
MEDLINE	zie 1.1.
Nursing	Referenties op het gebied van de Verpleegkunde
PreMEDLINE	zie 1.1.
Publisher	Referenties, die door uitgevers aan PubMed aangeboden worden; sommige komen later wel in Medline, andere niet
Toxicology	Referenties op het gebied van de toxicologie

2.9.10. Inperken op geslacht

De opties Female en Male zijn beschikbaar.

3. Referenties

Na een zoekactie verschijnt het referentie-scherm, met maximaal 20 referenties in het Summary-format.

Andere pagina's met referenties worden opgeroepen door bij Select page het desbetreffende paginanummer aan te klikken. De referenties worden op volgorde van invoerdatum gepresenteerd, de meest recente eerst.

Het referentie-scherm van PubMed

3.1. Preview

Wordt na het intypen van een of meer zoektermen op Go geklikt, dan verschijnt het referentie-scherm

Wordt op Preview geklikt (verschijnt na het aanklikken van Preview/Index), dan verschijnen geen referenties, maar een korte zoekgeschiedenis: het Preview-scherm.

Referenties kunnen vanaf het Preview-scherm worden opgeroepen door op het referentie-aantal te klikken.

3.2. Format van de referenties

Referenties worden standaard in het Summary-format gepresenteerd. Andere formaten worden gekozen door de opties onder Summary open te klikken, er een te kiezen, en vervolgens op Display te klikken.

Het Medline- dient gebruikt te worden voor opslag in een eigen database, bijvoorbeeld in Reference Manager (zie 3.8.).

3.3. Aantal referenties dat per pagina getoond wordt

Standaard worden 20 referenties per pagina getoond. Een ander aantal (maximaal 500) wordt ingesteld door dat aantal te kiezen en vervolgens op Display te klikken.

3.4. Related articles

Bij vrijwel elke referentie kan op Related Articles worden geklikt. De opgeroepen lijst bevat referenties die door de computer zijn geselecteerd - op grond van trefwoorden, titelswoorden e.d. - naar hun overeenkomst met de uitgangsreferentie. Deze uitgangsreferentie is steeds de eerste van de verwante referenties.

Een opgeroepen lijst van Related Articles krijgt een setnummer, en kan desgewenst via Limits ingeperkt worden, bijvoorbeeld op taal of op publicatiedatum.

3.5. Links naar full text artikelen

Bij sommige referenties wordt een link naar een full text artikel getoond. Dit is niet het geval bij het standaard Summary-format, maar wel bij o.a. het uitgebreide Citation- en het beknopte LinkOut-format.
De links werken alleen als het LUMC of de Universiteit Leiden toegang heeft tot de fulltext van het betreffende tijdschrift. Vanuit thuis kan dit alleen via Thuisnet2.

3.6. Selecteren van referenties; clipboard

Referenties kunnen geselecteerd worden door het vierkantje ervoor aan te klikken, waarin dan een V verschijnt. De geselecteerde referenties kunnen worden gedownload of afgedrukt (zie 3.8 en 3.9), of op het clipboard (prikbord) worden gezet door op Add to Clipboard te klikken. Referenties die op het clipboard gezet zijn hebben (ook op het referentie-scherm) een groen referentienummer.

Wordt op Add to Clipboard geklikt zonder referenties te selecteren, dan worden alle referenties uit de set (dus van alle pagina's) meegenomen.

Het clipboard heeft als functie een lijst van zelfgekozen referenties te maken - desgewenst afkomstig uit verschillende sets - die naderhand gedownload of afgedrukt wordt. Het clipboard kan maximaal 500 referenties bevatten

De referenties op het clipboard worden opgeroepen door op Clipboard te klikken. Bij het bekijken van het clipboard is de optie Add to Clipboard vervangen door Remove from Clipboard, die het verwijderen van referenties van het clipboard mogelijk maakt.

3.7. Sorteren van referenties

Referenties op het clipboard kunnen via Sort gesorteerd worden, op auteur, tijdschriftnaam of publicatiedatum.

3.8. Downloaden van referenties

Referenties uit een set (de referenties met een n of alle) of van het clipboard kunnen gedownload worden. Daartoe wordt (in het referentie- of het Clipboard-scherm) eerst het gewenste format ingesteld (zie 3.2.), en wordt vervolgens op Save geklikt.

De plaats van opslag kan men kiezen. Het maximum aantal referenties dat in één keer opgeslagen kan worden is 10.000.

Voor opslag in Reference Manager dient het Medline-format gekozen te worden. (Bij het invoeren in Reference Manager dient het Import Filter PubMed.cap gebruikt te worden. Zie ook handleiding Reference Manager)

3.9. Afdrukken van referenties

Referenties uit een set of van het clipboard kunnen worden afgedrukt. Daartoe wordt eerst het gewenste format (zie 3.2.) op het scherm opgeroepen, op één pagina (zie 3.3.). Deze pagina wordt afgedrukt met de Print-functie van de Internet-browser.

Als de gewenste set meer dan 500 referenties telt moet er in twee of meer porties worden afgedrukt.

 

Als bij het afdrukken blijkt dat een deel (rechterzijkant) van de tekst wegvalt, moet na het kiezen van het gewenste format op de optie Text geklikt worden. Daarmee wordt op het scherm een presentatie opgeroepen die goede afdrukresultaten levert.

4. Opslaan en later opnieuw uitvoeren van een zoekstrategie

Via de optie Details (beschikbaar op het referentie-scherm) wordt de zoekstrategie van een set getoond.

Via de optie URL (in het Details-scherm) kan de strategie worden opgeslagen, en later weer opgeroepen, op de volgende manier:

• Klik op URL: de zoekstrategie verschijnt op de zoekbalk.
• Klik op Favorites van de Web-browser
• Klik Add to Favorites: het Favorites-scherm verschijnt
• Vervang op de balk bij Name de standaard-naam Entrez-PubMed in een naam die de inhoud van de zoekstrategie weergeeft.
• Klik op OK: de bookmark met de zelfgekozen naam wordt opgeslagen.
• Oproepen van de bookmark leidt tot oproepen van de zoekstrategie.

 

Het is slechts mogelijk afzonderlijke sets op te slaan: één set per URL. In deze sets mogen geen setnummers verwerkt zijn. Voor het opslaan van zoekstrategieën dient dus een strategie in één keer te worden ingetypt, of stap voor stap, steeds voortbordurend op de voorafgaande stap, te worden opgebouwd.

5. Attenderingen via Cubby

Via de Cubby-optie (zijbalk) kunnen zoekprofielen ten behoeve van een attendering worden opgeslagen. Bij het oproepen ervan worden alleen die referenties geleverd die zijn toegevoegd sinds het opslaan van het profiel, respectievelijk sinds de vorige keer dat het profiel werd opgeroepen.

Voor het werken met Cubby is registratie nodig, met een zelfgekozen User Name en Password.
Het zoekprofiel dat met Cubby wordt opgeslagen dient uit één set te bestaan, waarin geen setnummers verwerkt mogen zijn.

Na het zoeken op deze set wordt op Cubby geklikt. De Cubby Search Name die vervolgens gepresenteerd wordt, is identiek aan de zoekstrategie, en kan in een zelfgekozen naam veranderd worden. Vervolgens wordt geklikt op Store in Cubby. Daarna, en tevens na het openen van Cubby, wordt een lijst van opgeslagen profielen getoond Na het aanklikken van een of meer profielnummers wordt op What's New for Selected geklikt, waarna gemeld wordt hoeveel nieuwe referenties er beschikbaar zijn. Na het aanklikken van het referentie-aantal verschijnen de bijbehorende referenties.

Bijlage 1. Alfabetische lijst van subheadings

Bijlage 2. Subheadings op onderwerp gerangschikt.

PubMed zoekt bij een subheading met een groepsbenaming automatisch op alle subheadings uit die groep

Bijlage 3. PubMed-zoekvelden en hun afkortingen

Bron: Walaeus Bibliotheek | Laatste wijziging: 23-07-2003
URL: www.pubmed.be/pubmed/handleiding.htm